Биоинформатика
Программа профессиональной переподготовки
252 академических часа
Старт программы: 4 марта 2025
252 академических часа
Старт программы: 4 марта 2025
О программе
Программа профессиональной переподготовки «Биоинформатика» это 4 отдельные программы повышения квалификации для любого уровня подготовки слушателя.
Модуль 1: Основы биоинформатики
Содержание
Модуль разработан для получения слушателями базовых знаний
о вычислительных методах для получения, анализа, хранения,
организации и визуализации биологических данных.
Даты обучения: 4 марта - 30 апреля 2025
В результате освоения программы повышения квалификации слушатель будет:
Знать:
1. Основы молекулярной биологии: ДНК, РНК, белки и экспрессия генов;
2. Нуклеотидные и аминокислотные последовательности: свойства, сходства и различия;
3. Базы данных и ресурсы: базы данных последовательностей, базы данных структур и базы данных путей.
Уметь:
1. Выполнять выравнивание последовательностей с помощью инструментов командной строки (например, ClustalW, BLAST);
2. Анализировать данные о последовательностях с помощью веб-инструментов (например, InterPro, KEGG);
3. Использовать контроль версий и инструменты совместной работы (например, Git, GitHub) для проектов по биоинформатике;
4. Выполнять крупномасштабный анализ последовательностей с использованием высокопроизводительных вычислений (например, кластеров, облаков).
Модуль включает в себя следующие темы:
Тема 1. Положение микроорганизмов в природе. Морфология и свойства бактерий
Тема 2. Перспективы развития и достижения современной микробиологии
Тема 3. Введение в молекулярную биологию и генетику
Тема 4. Языки программирования
Тема 5. Знакомство с ОС и командной строкой
Тема 6. Прикладная статистика в биоинформатике
Тема 7. Базы данных биоинформатики
Тема 8. Программы визуального моделирования трехмерных молекул
Трудоемкость обучения:
Трудоемкость обучения по данной программе составляет 54 академических часа, включая самостоятельную работу слушателей.
Форма обучения:
Очно с применением дистанционных технологий (вебинар с преподавателем)
Аттестация слушателей:
Итоговая аттестация проводится в виде выполнения итогового задания.
После окончания обучения выдается удостоверение о повышении квалификации.
о вычислительных методах для получения, анализа, хранения,
организации и визуализации биологических данных.
Даты обучения: 4 марта - 30 апреля 2025
В результате освоения программы повышения квалификации слушатель будет:
Знать:
1. Основы молекулярной биологии: ДНК, РНК, белки и экспрессия генов;
2. Нуклеотидные и аминокислотные последовательности: свойства, сходства и различия;
3. Базы данных и ресурсы: базы данных последовательностей, базы данных структур и базы данных путей.
Уметь:
1. Выполнять выравнивание последовательностей с помощью инструментов командной строки (например, ClustalW, BLAST);
2. Анализировать данные о последовательностях с помощью веб-инструментов (например, InterPro, KEGG);
3. Использовать контроль версий и инструменты совместной работы (например, Git, GitHub) для проектов по биоинформатике;
4. Выполнять крупномасштабный анализ последовательностей с использованием высокопроизводительных вычислений (например, кластеров, облаков).
Модуль включает в себя следующие темы:
Тема 1. Положение микроорганизмов в природе. Морфология и свойства бактерий
Тема 2. Перспективы развития и достижения современной микробиологии
Тема 3. Введение в молекулярную биологию и генетику
Тема 4. Языки программирования
Тема 5. Знакомство с ОС и командной строкой
Тема 6. Прикладная статистика в биоинформатике
Тема 7. Базы данных биоинформатики
Тема 8. Программы визуального моделирования трехмерных молекул
Трудоемкость обучения:
Трудоемкость обучения по данной программе составляет 54 академических часа, включая самостоятельную работу слушателей.
Форма обучения:
Очно с применением дистанционных технологий (вебинар с преподавателем)
Аттестация слушателей:
Итоговая аттестация проводится в виде выполнения итогового задания.
После окончания обучения выдается удостоверение о повышении квалификации.
Преподаватели модуля
Андрей Валерьевич
Дубровин
Дубровин
Доцент ординатуры факультета биотехнологий Университета ИТМО, кандидат ветеринарных наук
Екатерина Сергеевна
Пономарева
Пономарева
Биотехнолог молекулярно-генетической лаборатории , ООО «БИОТРОФ»
Андрей Андреевич
Пензин
Пензин
Младший научный сотрудник лаборатории биотехнологии ФГБНУ ФНЦ ВНИИ сои
Модуль 2: Анализ омиксных данных
Содержание
Сотрудники молекулярно-генетической лаборатории расскажут о базах данных генетической информации, секвенировании, сборке геномов и метагеномов, — всё необходимое для анализа омиксных данных.
Даты обучения: 6 мая - 17 июня 2025
Модуль включает в себя следующие темы:
Тема 1. Работа в командной строке. Базы данных генетической информации;
Тема 2. Контроль качества данных;
Тема 3. Виды секвенирования. WGS и ампликонный анализ;
Тема 4. De novo сборка геномов и метагеномов;
Тема 5. Работа с данными 16S rRNA, ITS, CO1;
Тема 6. Аннотирование результатов.
Трудоемкость обучения:
Трудоемкость обучения по данной программе составляет 36 академических часа, включая самостоятельную работу слушателей.
Форма обучения:
Онлайн в формате вебинаров с предподавателем
Аттестация слушателей:
В качестве итогового задания, для получения зачета, студентам будет необходимо выполнить проект, в который будет входить обработка сырых обезличенных данных полученных после NGS секвенирования и список программ необходимых для проведения анализа по аннотации данных, результаты которых будут ответом на вопрос в тестировании.
После окончания обучения выдается удостоверение о повышении квалификации.
Даты обучения: 6 мая - 17 июня 2025
Модуль включает в себя следующие темы:
Тема 1. Работа в командной строке. Базы данных генетической информации;
Тема 2. Контроль качества данных;
Тема 3. Виды секвенирования. WGS и ампликонный анализ;
Тема 4. De novo сборка геномов и метагеномов;
Тема 5. Работа с данными 16S rRNA, ITS, CO1;
Тема 6. Аннотирование результатов.
Трудоемкость обучения:
Трудоемкость обучения по данной программе составляет 36 академических часа, включая самостоятельную работу слушателей.
Форма обучения:
Онлайн в формате вебинаров с предподавателем
Аттестация слушателей:
В качестве итогового задания, для получения зачета, студентам будет необходимо выполнить проект, в который будет входить обработка сырых обезличенных данных полученных после NGS секвенирования и список программ необходимых для проведения анализа по аннотации данных, результаты которых будут ответом на вопрос в тестировании.
После окончания обучения выдается удостоверение о повышении квалификации.
Преподаватели модуля
Екатерина Сергеевна
Пономарева
Пономарева
биотехнолог молекулярно-генетической лаборатории ООО "БИОТРОФ"
Модуль 3: Белковая инженерия in silico
Содержание
Об основах генной инженерии, биоаналитики, биомедицинских и биотехнологических производств, компьютерного моделирования – для подбора биологических объектов и применения их в биотехнологических процессах для конструирования новых свойств белков.
Даты обучения: 10 июля - 1 сентября 2025
Модуль включает в себя следующие темы:
Тема 1. Введение в белковую инженерию
Тема 2. Поиск белков и выравнивание гомологов
Тема 3. 3D-моделирование и исследование укладки белков
Тема 4. Компьютерное моделирование взаимодействия белков
Тема 5. Создание виртуального белка с заданными свойствами
Трудоемкость обучения:
Трудоемкость обучения по данной программе составляет 54 академических часа, включая самостоятельную работу слушателей.
Форма обучения:
Онлайн в формате вебинаров с преподавателем
Аттестация слушателей:
Итоговая аттестация проводится в виде выполнения итогового задания
Даты обучения: 10 июля - 1 сентября 2025
Модуль включает в себя следующие темы:
Тема 1. Введение в белковую инженерию
Тема 2. Поиск белков и выравнивание гомологов
Тема 3. 3D-моделирование и исследование укладки белков
Тема 4. Компьютерное моделирование взаимодействия белков
Тема 5. Создание виртуального белка с заданными свойствами
Трудоемкость обучения:
Трудоемкость обучения по данной программе составляет 54 академических часа, включая самостоятельную работу слушателей.
Форма обучения:
Онлайн в формате вебинаров с преподавателем
Аттестация слушателей:
Итоговая аттестация проводится в виде выполнения итогового задания
Преподаватели модуля
Андрей Андреевич
Пензин
Пензин
Младший научный сотрудник лаборатории биотехнологии ФГБНУ ФНЦ ВНИИ сои
Модуль 4: Практикум по биоинформатике
Содержание
Пройдете стажировку, работая с реальными задачами в областях биомедицины, биотехнологии и биологии от научных групп Томского государственного университета и партнеров программы.
Даты обучения: 2 сентября - 17 октября 2025
В период прохождения практикума слушатель изучает следующие темы:
Тема 1. Способы организации поисковых исследований с данными биоинформатики;
Тема 2. Инструменты биоинформатики для решения конкретных биомедицинских задач;
Тема 3. Инструменты биоинформатики для решения конкретных биотехнологических задач;
Тема 4. Инструменты биоинформатики для решения конкретных биологических задач.
Примерные темы для индивидуального задания на практикум:
1) Паспортизация и идентификация сортов сои с использованием анализа SSRs локусов;
2) Предсказание функциональных свойств химерного белка у малярийного комара Anopheles messeae с хромосомной инверсией 2R1;
3) Анализ структуры, функций и эволюции белка репарации AGAP004286-PA у малярийного комара Anopheles gambiae;
4) Метагеномика рака полости рта;
5) Пространственная транскриптомика рака полости рта;
6) Транскриптомика опухолевых гибридных клеток на уровне единичных клеток;
7) Транскриптомика циркулирующих опухолевых клеток на уровне единичных клеток
8) Мутационный ландшафт рака лёгкого;
9) Полногеномный поиск ассоциаций (GWAS) герминальных вариантов с риском метастазирования и рецидивирования рака лёгкого;
10) Дизайн олигонуклеотидов для гибридизационного обогащения ДНК-последовательностей;
11) Биоинформатический анализ публичных данных TCGA;
12) Identification of stress-specific and common genes in selected plant species;
13) Evolution of plant-pathogen interaction pathway in kingdom plantae.
Трудоемкость обучения:
Трудоемкость обучения по данной программе составляет 72 академических часа, включая самостоятельную работу слушателей.
Форма обучения:
Очно с применением дистанционных образовательных технологий.
Аттестация слушателей:
Итоговая аттестация проводится в форме защиты презентации о выполненной работе.
После окончания обучения выдается удостоверение о повышении квалификации.
Даты обучения: 2 сентября - 17 октября 2025
В период прохождения практикума слушатель изучает следующие темы:
Тема 1. Способы организации поисковых исследований с данными биоинформатики;
Тема 2. Инструменты биоинформатики для решения конкретных биомедицинских задач;
Тема 3. Инструменты биоинформатики для решения конкретных биотехнологических задач;
Тема 4. Инструменты биоинформатики для решения конкретных биологических задач.
Примерные темы для индивидуального задания на практикум:
1) Паспортизация и идентификация сортов сои с использованием анализа SSRs локусов;
2) Предсказание функциональных свойств химерного белка у малярийного комара Anopheles messeae с хромосомной инверсией 2R1;
3) Анализ структуры, функций и эволюции белка репарации AGAP004286-PA у малярийного комара Anopheles gambiae;
4) Метагеномика рака полости рта;
5) Пространственная транскриптомика рака полости рта;
6) Транскриптомика опухолевых гибридных клеток на уровне единичных клеток;
7) Транскриптомика циркулирующих опухолевых клеток на уровне единичных клеток
8) Мутационный ландшафт рака лёгкого;
9) Полногеномный поиск ассоциаций (GWAS) герминальных вариантов с риском метастазирования и рецидивирования рака лёгкого;
10) Дизайн олигонуклеотидов для гибридизационного обогащения ДНК-последовательностей;
11) Биоинформатический анализ публичных данных TCGA;
12) Identification of stress-specific and common genes in selected plant species;
13) Evolution of plant-pathogen interaction pathway in kingdom plantae.
Трудоемкость обучения:
Трудоемкость обучения по данной программе составляет 72 академических часа, включая самостоятельную работу слушателей.
Форма обучения:
Очно с применением дистанционных образовательных технологий.
Аттестация слушателей:
Итоговая аттестация проводится в форме защиты презентации о выполненной работе.
После окончания обучения выдается удостоверение о повышении квалификации.
Преподаватели модуля, руководители проектов
Глеб Николаевич
Артемов
Артемов
Кандидат биологических наук, доцент кафедры генетики и клеточной биологии БИ ТГУ, лаборатории экологии, генетики и охраны окружающей среды БИ ТГУ
Павел Дмитриевич
Тимкин
Тимкин
Исполняющий обязанности заведующего лабораторией биотехнологии ФГБНУ ФНЦ ВНИИ сои
Павел Сергеевич
Ямщиков
Ямщиков
Младший научный сотрудник, лаборатория комплексного анализа больших данных био-изображений ТГУ, биоинформатик Лаборатории биологии опухолевой прогрессии НИИ онкологии ТНИМЦ
Андрей Андреевич
Пензин
Пензин
младший научный сотрудник лаборатории биотехнологии ФГБНУ ФНЦ ВНИИ сои
Наваз Мухаммад Амджад
PhD, старший научный сотрудник, НОЦ ПИШ "Агробиотек" ТГУ
Ирина Александровна
Курзина
Курзина
Д-р физ.мат. наук, зав. кафедрой ПСФиМХ ХФ ТГУ
Екатерина Сергеевна
Пономарева
Пономарева
Биотехнолог молекулярно-генетической лаборатории ООО "Биотроф"
Подготовка и защита выпускной аттестационной работы
Аттестация
За прохождение каждого модуля выдается удостоверение о повышении квалификации.
Диплом о профессиональной переподготовке после завершения 4 модулей программы и защиты итоговой аттестационной работы.
Диплом о профессиональной переподготовке после завершения 4 модулей программы и защиты итоговой аттестационной работы.
ТГУ – это…
- Престижный сибирский университет с историей и традициями
- Качественное современное высшее образование
- Уверенность в будущем и успешная карьера
- Обширные международные связи
- Престижный сибирский университет с историей и традициями
- Качественное современное высшее образование
- Уверенность в будущем и успешная карьера
- Обширные международные связи
4
место среди российских вузов по рейтингу QS
4
место среди российских вузов Бриллиантовой лиги Round University Ranking
7
место рейтинга «Интерфакс» лучшие университеты России 2022 по параметру «Инновации»
20
место в рейтинге российских вузов по версии Forbes
Отзывы о программе
Отзывы о программе
Артем Зорин
Сотрудник ООО "Компания БКС" Томск, магистрант НОЦ ПИШ "Агробиотек"
«Программа переподготовки ТГУ по Биоинформатике - это отличная возможность получить образование и диплом по современной востребованной специальности. Данное направление междисциплинарное, что позволяет развивать компетенции сразу по нескольким направлениям, включая особо востребованные на рынке труда в области информационных технологий.
Программа переподготовки отличается передовой системой организации и проведения. Прием документов на поступление и зачисление на курс осуществляется через электронные системы документооборота. Обучение проходит в онлайн формате с возможностью просмотра записей занятий в удобное время. Переподготовка организована по модульной схеме с получением удостоверения о повышении квалификации за каждый успешно пройденный модуль. Такие продуманные условия привлекают и позволяют легко повысить уровень квалификации обучающемуся из любого региона страны и даже из других стран.
Содержание образовательной программы переподготовки интересно и насыщенно. Помимо интерактивной онлайн теоретической части, также предусмотрены онлайн практические занятия с использованием современных баз данных и программного обеспечения. Качество презентаций и прекрасная ориентация преподавателей в обширном и сложном материале курса помогают в его освоении и показывают высокую заинтересованность в обучении и развитии своих слушателей, вызывая доверие и уважение.
По итогам прохождения модулей курса значительно улучшил свои компетенции в области биоинформатики и рекомендую данную программу всем, кто хочет быть востребованным специалистом в современном технологично устроенном мире.
Спасибо преподавателям, а также организаторам программы: руководителю программы Курзиной Ирине Александровне, Анищенко Юлии Владимировне, Пахомовой Валерии за организацию, проведение обучающих мероприятий, позволяющих повышать уровень квалификации в научно-практической сфере биотехнологий, а также за компетентную доступную коммуникацию»
Программа переподготовки отличается передовой системой организации и проведения. Прием документов на поступление и зачисление на курс осуществляется через электронные системы документооборота. Обучение проходит в онлайн формате с возможностью просмотра записей занятий в удобное время. Переподготовка организована по модульной схеме с получением удостоверения о повышении квалификации за каждый успешно пройденный модуль. Такие продуманные условия привлекают и позволяют легко повысить уровень квалификации обучающемуся из любого региона страны и даже из других стран.
Содержание образовательной программы переподготовки интересно и насыщенно. Помимо интерактивной онлайн теоретической части, также предусмотрены онлайн практические занятия с использованием современных баз данных и программного обеспечения. Качество презентаций и прекрасная ориентация преподавателей в обширном и сложном материале курса помогают в его освоении и показывают высокую заинтересованность в обучении и развитии своих слушателей, вызывая доверие и уважение.
По итогам прохождения модулей курса значительно улучшил свои компетенции в области биоинформатики и рекомендую данную программу всем, кто хочет быть востребованным специалистом в современном технологично устроенном мире.
Спасибо преподавателям, а также организаторам программы: руководителю программы Курзиной Ирине Александровне, Анищенко Юлии Владимировне, Пахомовой Валерии за организацию, проведение обучающих мероприятий, позволяющих повышать уровень квалификации в научно-практической сфере биотехнологий, а также за компетентную доступную коммуникацию»
Александра Савченко
студент программы TISP Томского государственного университета
«Я прошла онлайн-курс по биоинформатике и осталась очень довольна полученным опытом. Курс был структурированным, и охватывал все ключевые аспекты этой быстро развивающейся области.
Преподаватели были высококвалифицированными специалистами, которые делились своими знаниями и опытом, что сделало обучение особенно ценным. В целом, курс по биоинформатике стал для меня отличной основой для дальнейшего изучения этой области. Я рекомендую его всем, кто интересуется пересечением биологии и информатики, и хочет получить практические навыки, которые будут полезны в научной и исследовательской деятельности»
Преподаватели были высококвалифицированными специалистами, которые делились своими знаниями и опытом, что сделало обучение особенно ценным. В целом, курс по биоинформатике стал для меня отличной основой для дальнейшего изучения этой области. Я рекомендую его всем, кто интересуется пересечением биологии и информатики, и хочет получить практические навыки, которые будут полезны в научной и исследовательской деятельности»
Елизавета Слепнева
Лаборант-исследователь ФГБОУ "Петербургский институт ядерной физики им. Б.П. Константинова национального исследовательского центра "Курчатовский институт"
«Очень понравилась организация учебного процесса, в частности, что лекции можно посмотреть в записи. В другом формате было бы трудно и даже скорее всего невозможно совмещать с работой и учебой в аспирантуре.
Очень бы еще хотелось поблагадарить преподователей за интересный теоретический и практический материал, за бессценную возможность связи... За отзывчивость! Большое спасибо!»
Очень бы еще хотелось поблагадарить преподователей за интересный теоретический и практический материал, за бессценную возможность связи... За отзывчивость! Большое спасибо!»
Стоимость обучения
Остались вопросы?
г. Томск,ул. Герцена, 2 / Ново-Соборная площадь, 1 ст2, офис 20
+7 (382) 278 53 41
smti@mail.tsu.ru